Charakterystyka, funkcje i typy metaloproteinaz

3162
Simon Doyle

Plik metaloproteinazy lub metaloproteazy są enzymami, które rozkładają białka i które wymagają obecności atomu metalu, aby mieć aktywność. Ramieniem wykonawczym wszystkich czynności wykonywanych przez komórkę są enzymy.

Chociaż wiele białek pełni rolę strukturalną, duża ich liczba, jeśli nie większość, ma pewną aktywność katalityczną. Grupa tych enzymów jest odpowiedzialna za degradację innych białek.

Struktura metaloproteiny MMP2. Zaczerpnięte i zredagowane z Emw [CC BY-SA 3.0 lub GFDL], z Wikimedia Commons.

Zbiorczo te enzymy nazywane są proteinazami lub proteazami. Grupa proteaz, które wymagają, aby atom metalu był aktywny, nazywa się metaloproteinazami.

Indeks artykułów

  • 1 Funkcje
  • 2 Ogólna charakterystyka metaloproteinaz
  • 3 Klasyfikacja
    • 3.1 -Ezopeptydazy metaloproteinaz
    • 3.2 - Endopeptydazy metaloproteinaz
  • 4 Inne funkcje i zmiany
    • 4.1 Modyfikacja białka
    • 4.2 Skutki zdrowotne
  • 5 Powiązane patologie
  • 6 Zastosowania terapeutyczne
  • 7 Referencje

funkcje

Generalnie proteazy spełniają ważną i liczną grupę zadań w komórce. Najbardziej globalnym zadaniem jest umożliwienie wymiany białek obecnych w komórce.

Oznacza to, że wyeliminuj stare białka i pozwól na ich zastąpienie przez nowe białka. Syntetyzowane są nowe białka de novo na rybosomach podczas procesu tłumaczenia.

W szczególności najważniejszą rolą metaloproteinaz jest regulacja zachowania komórek. Osiąga się to dzięki tej szczególnej grupie proteaz poprzez kontrolowanie obecności i czasu obecności regulatorów transkrypcji, mediatorów odpowiedzi, receptorów, strukturalnych białek błonowych i organelli wewnętrznych itp..

W zależności od sposobu degradacji proteazy, w tym metaloproteinazy, dzieli się na endoproteazy (metaloendoproteazy) lub egzoproteazy (metaloeksoproteazy)..

Te pierwsze degradują białka z jednego końca białka (tj. Aminowego lub karboksylowego). Z drugiej strony endoproteazy dokonują nacięć wewnątrz białka z pewną specyficznością.

Ogólna charakterystyka metaloproteinaz

Metaloproteinazy są prawdopodobnie najbardziej zróżnicowaną grupą spośród sześciu istniejących proteaz. Proteazy są klasyfikowane zgodnie z ich mechanizmem katalitycznym. Te grupy to proteazy cysteiny, seryny, treoniny, kwasu asparaginowego, kwasu glutaminowego i metaloproteinaz..

Wszystkie metaloproteinazy wymagają atomu metalu do przeprowadzenia katalitycznego rozszczepienia. Metale obecne w metaloproteinazach obejmują głównie cynk, ale inne metaloproteinazy wykorzystują kobalt.

Aby atom metalu spełniał swoją funkcję, musi być koordynowany w kompleksie z białkiem. Odbywa się to za pośrednictwem czterech punktów kontaktowych.

Trzy z nich używają jednego z naładowanych aminokwasów histydyny, lizyny, argininy, glutaminianu lub asparaginianu. Czwarty punkt koordynacyjny tworzy cząsteczka wody.

Klasyfikacja

Międzynarodowa Unia Biochemii i Biologii Molekularnej ustanowiła system klasyfikacji enzymów. W tym systemie enzymy są identyfikowane za pomocą liter EC i skodyfikowanego systemu czterech cyfr.

Pierwsza liczba identyfikuje enzymy zgodnie z ich mechanizmem działania i dzieli je na sześć dużych klas. Druga liczba oddziela je według podłoża, na którym działają. Pozostałe dwie liczby wykonują jeszcze bardziej szczegółowe podziały.

Ponieważ metaloproteinazy katalizują reakcje hydrolizy, zgodnie z tym systemem klasyfikacji są one identyfikowane numerem EC4. Dodatkowo należą do podklasy 4, w której znajdują się wszystkie hydrolazy działające na wiązania peptydowe..

Metaloproteinazy, podobnie jak pozostałe proteinazy, można sklasyfikować według miejsca atakującego łańcucha polipeptydowego.

-Egzopeptydazy metaloproteinaz

Działają na wiązania peptydowe końcowych aminokwasów łańcucha polipeptydowego. Uwzględniono tu wszystkie metaloproteinazy, które mają dwa katalityczne jony metali, a niektóre z jednym jonem metalu..

-Endopeptydazy metaloproteinaz

Działają na każde wiązanie peptydowe w łańcuchu polipeptydowym, w wyniku czego powstają dwie cząsteczki polipeptydu o niższej masie cząsteczkowej..

W ten sposób działa wiele metaloproteinaz z jednym katalitycznym jonem metalu. Obejmuje to metaloproteinazy macierzy i białka ADAM.

Metaloproteinazy macierzy (MMP)

Są to enzymy zdolne do katalitycznego działania na niektóre składniki macierzy zewnątrzkomórkowej. Macierz zewnątrzkomórkowa to zbiór wszystkich substancji i materiałów, które są częścią tkanki i znajdują się na zewnątrz komórek.

Stanowią dużą grupę enzymów obecnych w procesach fizjologicznych i uczestniczą w zmianach morfologicznych i funkcjonalnych wielu tkanek..

Na przykład w mięśniach szkieletowych odgrywają bardzo ważną rolę w tworzeniu, przebudowie i regeneracji tkanki mięśniowej. Działają również na różne typy kolagenów obecnych w macierzy zewnątrzkomórkowej.

Kolagenazy (MMP-1, MMP-8, MMP-13, MMP-18)

Enzymy hydrolityczne działające na kolagen typu I, II i III znajdujący się między komórkami. Produkt katabolizmu tych substancji uzyskuje się zdenaturowany kolagen lub żelatynę.

U kręgowców enzym ten jest wytwarzany przez różne komórki, takie jak fibroblasty i makrofagi, a także przez komórki nabłonka. Mogą również działać na inne cząsteczki macierzy zewnątrzkomórkowej.

Żelatynazy (MMP-2, MMP-9)

Pomagają w procesie katabolizmu kolagenów typu I, II i III. Działają również na zdenaturowany kolagen lub żelatynę otrzymaną po działaniu kolagenaz..

Stromalizyny (MMP-3, MMP-10, MMP-11)

Działają na kolageny typu IV i inne cząsteczki macierzy zewnątrzkomórkowej związane z kolagenem. Jego działanie na żelatynę jest ograniczone.

Stromalisin Struktura metaloproteinazy macierzy MMP3. Zrobione i zredagowane przez Emw [CC BY-SA 3.0 (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0) lub GFDL (http://www.gnu.org/copyleft/fdl.html)], z Wikimedia Commons.
Matrilisins (MMP-7, MMP-26).

Są strukturalnie prostszymi metaloproteinazami niż inne. Są spokrewnione z komórkami nabłonka guza.

Metaloproteazy związane z błoną (MT-MMP)

Są częścią membran fundamentowych. Biorą udział w proteolitycznej aktywności innych metaloproteinaz macierzy.

Neprilysin

Neprylizyna jest metaloproteinazą macierzy zawierającą cynk jako jon katalityczny. Odpowiada za hydrolizę peptydów na końcu aminowym reszty hydrofobowej.

Enzym ten znajduje się w wielu narządach, w tym w nerkach, mózgu, płucach, mięśniach gładkich naczyń krwionośnych, a także w komórkach śródbłonka, serca, krwi, tkanki tłuszczowej i fibroblastów..

Neprylizyna jest niezbędna do metabolicznego rozkładu peptydów wazoaktywnych. Niektóre z tych peptydów działają rozszerzająco na naczynia, ale inne mają działanie zwężające naczynia..

Hamowanie neprysiliny w połączeniu z hamowaniem receptora angiotensyny stało się bardzo obiecującą alternatywną terapią w leczeniu pacjentów z niewydolnością serca.

Inne metaloproteinazy macierzy

Istnieje kilka metaloproteinaz, które nie należą do żadnej z powyższych kategorii. Przykład z nich mamy MMP-12; MMP-9; MMP-20; MMP-22; MMP-23 i MMP-28.

-Białka ADAM

ADAM (dezintegrina i metaloproteaza) to grupa metaloproteinaz, zwanych metaloproteinazami - dezintegrynami..

Należą do nich enzymy, które tną lub usuwają części białek, które są wykluczone z komórki przez błonę komórkową..

Niektóre ADAM, zwłaszcza u ludzi, nie posiadają funkcjonalnej domeny proteazy. Jego główne funkcje obejmują działanie na spermatogenezę i fuzję plemnika z jajkiem. Są ważnym składnikiem jadu wielu węży.

Inne funkcje i zmiany

Modyfikacja białka

Metaloproteinazy mogą uczestniczyć w modyfikacji (dojrzewaniu) niektórych białek w procesach potranslacyjnych.

Może to nastąpić jednocześnie lub po syntezie białka docelowego lub w końcowym miejscu, w którym znajduje się ono w celu wykonywania swojej funkcji. Osiąga się to na ogół przez odcięcie ograniczonej liczby reszt aminokwasowych z cząsteczki docelowej..

W bardziej rozległych reakcjach rozszczepienia docelowe białka mogą ulec całkowitej degradacji.

Efekty zdrowotne

Każda zmiana w funkcjonowaniu metaloproteinaz może mieć niepożądany wpływ na zdrowie człowieka. Uzupełniająco, niektóre inne procesy patologiczne obejmują w pewien sposób udział tej ważnej grupy enzymów.

Na przykład metaloproteinaza macierzy 2 odgrywa ważną rolę w inwazji, progresji i przerzutach raka, w tym raka endometrium. W innych przypadkach zmiana homeostazy MME była powiązana z zapaleniem stawów, zapaleniem i niektórymi typami raka.

Wreszcie metaloproteinazy pełnią w przyrodzie inne funkcje niezwiązane bezpośrednio z fizjologią człowieka, który je wytwarza. Na przykład dla niektórych zwierząt produkcja trucizn jest ważna ze względu na sposób ich przetrwania..

W rzeczywistości jad wielu węży zawiera złożoną mieszankę związków bioaktywnych. Wśród nich jest kilka metaloproteinaz, które powodują między innymi krwawienie, uszkodzenie tkanek, obrzęk, martwicę i inne skutki u ofiary..

Powiązane patologie

Możliwe było ustalenie, że enzymy z rodziny MMP uczestniczą w rozwoju różnych chorób; choroby skóry, dysfunkcje naczyniowe, marskość wątroby, rozedma płuc, niedokrwienie mózgu, artretyzm, paradontoza i przerzuty nowotworowe m.in..

Uważa się, że duża różnorodność form, które mogą występować w metaloproteinazach macierzy, może sprzyjać zmianie kilku mechanizmów regulacji genetycznej, prowadząc w ten sposób do zmiany profilu genetycznego.

Aby zahamować rozwój patologii związanych z MMP, stosowano różne inhibitory metalopreinaz, zarówno naturalne, jak i sztuczne..

Naturalne inhibitory zostały wyizolowane z wielu organizmów morskich, w tym ryb, mięczaków, alg i bakterii. Z drugiej strony syntetyczne inhibitory na ogół zawierają grupę chelatującą, która wiąże i dezaktywuje katalityczny jon metalu. Wyniki uzyskane dzięki tym terapiom nie są jednak rozstrzygające.

Zastosowania terapeutyczne

Metaloproteinazy macierzy mają kilka zastosowań terapeutycznych. Stosowane są w leczeniu oparzeń, a także różnego rodzaju owrzodzeń. Były również stosowane do usuwania tkanki bliznowatej i ułatwiania procesu regeneracji przy przeszczepach narządów..

Bibliografia

  1. Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Walters, P. (2014) Molecular biology of the cell, 6th Wydanie. Garland Science, Taylor & Francis Group. Abingdon-on-Thames, Wielka Brytania.
  2. Caley, M. P., Martins, V. L. C., O'Toole, E. A. (2015) Metalloproteinases and ran treatment. Postępy w leczeniu ran, 4: 225–234.
  3. Löffek, S., Schilling, O., Franzke, C.-W. (2011) Biologiczna rola metaloproteinaz macierzy: krytyczna równowaga. European Respiratory Journal, 38: 191–208.
  4. Opalińska, M., Jańska, H. (2018) Proteazy AAA: strażnicy funkcji mitochondrialnej i homeostazy. Cells, 7: 163. doi: 10.3390 / cell7100163.
  5. Rima, M., Alavi-Naini, S. M., Karam, M., Sadek, R., Sabatier, J.-M., Fajloun, Z. (2018) Vipers of the Middle East: the rich source of bioactive Molules. Molekuły.

Jeszcze bez komentarzy