Biografia, taksonomia, składki, prace Carla Woese

3082
Philip Kelley

Carl Woese (1928-2012) był wybitnym amerykańskim mikrobiologiem, którego praca zrewolucjonizowała rozumienie świata drobnoustrojów, a także sposób postrzegania związków wszelkiego życia na Ziemi.

Bardziej niż jakikolwiek inny badacz Carl Woese skupił uwagę świata naukowego na niematerialnym, ale dominującym świecie drobnoustrojów. Ich praca pozwoliła nam poznać i przeanalizować królestwo, które wykracza daleko poza chorobotwórcze bakterie..

Carl Richard Woese był amerykańskim mikrobiologiem, którego praca zrewolucjonizowała rozumienie świata drobnoustrojów. Źródło: Don Hamerman [domena publiczna]

Poprzez swoje prace Woese rozwinął rozumienie rozwoju życia; Osiągnięto to dzięki sekwencji genów istot żywych, pokazując w ten sposób, że historię ewolucji można prześledzić wstecz do wspólnego przodka.

Ponadto podczas tego dochodzenia Woese odkrył trzecią domenę życia, znaną jako łuki.

Indeks artykułów

  • 1 Biografia
    • 1.1 Ludzka strona Woese
    • 1.2 Nagrody i wyróżnienia
    • 1.3 Określanie postępów naukowych w wizji Woese
    • 1.4 Kod genetyczny
  • 2 Taksonomia molekularna
    • 2.1 Trzy domeny
    • 2.2 Filogenetyczne drzewo życia
  • 3 Inne wkłady od Woese
    • 3.1 Wkład w ekologię Ziemi
    • 3.2 Projekt ludzkiego mikrobiomu
    • 3.3 Egzobiologia
  • 4 Główne prace
  • 5 Referencje

Biografia

Carl Richard Woese urodził się w 1928 roku w Syracuse w stanie Nowy Jork. Studiował matematykę i fizykę w Amherst College w Massachusetts i uzyskał tytuł doktora. Doktorat z biofizyki na Uniwersytecie Yale w 1953 roku.

Woese odbył szkolenie u czołowych badaczy i laureatów Nagrody Nobla, takich jak jego dyplomowany instruktor, biofizyk Ernest Pollard, który sam był studentem laureata Nagrody Nobla w dziedzinie fizyki Jamesa Chadwicka..

Zainteresowanie Woese'a pochodzeniem kodu genetycznego i rybosomów rozwinęło się podczas pracy jako biofizyk w General Electric Research Laboratory. Później, w 1964 roku, amerykański biolog molekularny Sol Spiegelman zaprosił go na wydział Uniwersytetu Illinois, gdzie pozostał aż do śmierci (2012)..

Carl Woese (po lewej), Ralph Wolfe i Otto Kandler (po prawej), 1981. Źródło: Maya Kandler [CC BY-SA 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0)]

Ludzka strona Woese

Według jego bliskich współpracowników, Woese był głęboko oddany swojej pracy i był bardzo odpowiedzialny za swoje badania. Jednak wielu twierdzi, że mikrobiolog dobrze się bawił podczas wykonywania swojej pracy. Ponadto jego rówieśnicy opisywali go jako błyskotliwą, zaradną, uczciwą, hojną i pokorną osobę..

Nagrody i wyróżnienia

Przez lata swoich badań otrzymał wiele nagród i wyróżnień, m.in. MacArthur Fellowship. Był także członkiem Narodowej Akademii Nauk Stanów Zjednoczonych i Towarzystwa Królewskiego.

W 1992 roku Woese otrzymał medal Leeuwenhoek od Królewskiej Holenderskiej Akademii Sztuk i Nauk - uważany za najwyższą nagrodę w dziedzinie mikrobiologii - aw 2002 roku został odznaczony Narodowym Medalem Nauki Stanów Zjednoczonych..

Podobnie, w 2003 r. Otrzymał nagrodę Crafoord przyznaną przez Królewską Szwedzką Akademię Nauk w dziedzinie nauk biologicznych, będącą równoległą nagrodą Nobla..

Określanie postępów naukowych w wizji Woese

W latach siedemdziesiątych biologia sklasyfikowała żywe istoty do pięciu dużych królestw: rośliny, zwierzęta, grzyby, prokarioty (lub bakterie), proste komórki bez struktury wewnętrznej oraz eukarionty, które mają jądro i inne składniki w swoich komórkach..

Jednak postęp w biologii molekularnej pozwolił Woese spojrzeć na podstawy życia na Ziemi z innej perspektywy. W ten sposób pokazał, że życie w każdym z pięciu królestw ma tę samą podstawę, taką samą biochemię i ten sam kod genetyczny..

Kod genetyczny

Po odkryciu kwasów nukleinowych, kwasu dezoksyrybonukleinowego (DNA) i kwasu rybonukleinowego (RNA) ustalono, że kod genetyczny jest przechowywany w tych dwóch makrocząsteczkach. Zasadniczą cechą DNA i RNA jest to, że składają się one z powtórzeń mniejszych cząsteczek zwanych nukleotydami..

Dzięki temu udało się ustalić, że ogromna różnorodność życia wynika z różnic w składowych nukleotydów tych dwóch cząsteczek.

W związku z tym wkład Woese dotyczący sposobu zrozumienia i określenia struktury RNA był istotny. Po przeprowadzeniu tych badań Woese szczególnie zainteresował się badaniem ewolucji kodu genetycznego.

Taksonomia molekularna

Carl Woese zbadał określony zestaw informacji genetycznych znalezionych w tzw Mitochondrialne RNA 16s. Sekwencja genetyczna tego RNA ma tę cechę, że pojawia się w genomach wszystkich żywych istot i jest wysoce konserwatywna, co oznacza, że ​​ewoluowała powoli i może być używana do śledzenia zmian ewolucyjnych przez długi czas..

Aby zbadać RNA, Woese wykorzystał technologię sekwencjonowania kwasów nukleinowych, która w latach 70. była wciąż bardzo prymitywna. Porównanie sekwencji rybosomalnego RNA (rRNA) z różnych organizmów, głównie bakterii i innych mikroorganizmów.

Później, w 1977 roku, wraz z Georgem Foxem opublikował pierwsze filogenetyczne drzewo życia oparte na nauce. To mapa ukazująca organizację życia na dużą skalę i przebieg ewolucji.

Trzy domeny

Model ewolucji użyty przed pracą Woese wskazywał, że istoty żywe zostały podzielone na dwie duże grupy: prokarionty i eukarionty. Ponadto wskazał, że prokarionty dały początek bardziej nowoczesnym eukariontom..

Jednak Woese zsekwencjonował i porównał geny rRNA różnych żywych istot i odkrył, że im większa jest zmienność sekwencji genów dwóch organizmów, tym większa jest ich ewolucyjna rozbieżność..

Te odkrycia pozwoliły mu zaproponować trzy linie ewolucyjne, zwane domenami: Bakterie i Archaea (reprezentujące komórki prokariotyczne, to znaczy bez jądra) i Eukarya (komórki eukariotyczne z jądrem).

Archaeas to komórki prokariotyczne, to znaczy bez jądra

W ten sposób Woese ustalił, że koncepcja prokariontów nie ma uzasadnienia filogenetycznego, a eukarionty nie pochodzą od bakterii, ale są siostrzaną grupą archeonów..

Filogenetyczne drzewo życia

Trzy domeny zostały przedstawione w drzewie filogenetycznym, na którym pokazane są różnice ewolucyjne. Na tym drzewie odległość między dwoma gatunkami - narysowana wzdłuż linii, które je łączą - jest proporcjonalna do różnicy w ich rRNA..

Podobnie te, które są szeroko rozdzielone w drzewie, są bardziej odległymi krewnymi, a dzięki połączeniu dużej ilości danych można oszacować relacje między gatunkami i określić, kiedy jedna linia oddzieliła się od drugiej..

Inne wkłady od Woese

Praca i odkrycia Woese wywarły głęboki wpływ na sposób zrozumienia rozwoju mikrobiologicznej ekologii ziemi i organizmu ludzkiego; nawet poza domenami ziemskimi.

Wkład w ekologię Ziemi

Ekosystemy drobnoustrojów są podstawą biosfery Ziemi i zanim opracowano ramy filogenetyczne oparte na sekwencjach Woese, nie było żadnego sensownego sposobu oceny relacji między mikrobami, które tworzą świat przyrody..

Odkrycie Woese wykazało, że całe życie na Ziemi wywodzi się ze stanu przodków, który istniał 3,8 miliarda lat temu, a kluczowe elementy współczesnej komórki są już ustalone..

W ten sposób dyscyplina ekologii drobnoustrojów została przeniesiona ze stanu umierającego do jednej z najbardziej tętniących życiem dziedzin biologii o ważnych konsekwencjach dla medycyny, jak wykazał projekt Human Microbiome Project..

Projekt ludzkiego mikrobiomu

Projekt Ludzkiego Mikrobiomu został zaproponowany w 2008 roku przez Narodowy Instytut Zdrowia Stanów Zjednoczonych (NIH), a fundamentalną podstawą tego projektu są ustalenia Woese.

Głównym celem tej wielkiej inicjatywy jest identyfikacja i scharakteryzowanie zbiorowisk drobnoustrojów obecnych w ludzkim ciele oraz poszukiwanie korelacji między dynamiką populacji drobnoustrojów, zdrowiem człowieka i chorobami..

Egzobiologia

Egzobiologia podejmuje próbę rekonstrukcji historii procesów i wydarzeń związanych z przemianami pierwiastków biogennych, od ich powstania w nukleosyntezie po udział w darwinowskiej ewolucji w Układzie Słonecznym..

W związku z tym egzobiologia zajmuje się podstawowymi aspektami biologii poprzez badanie życia poza Ziemią. Powstaje więc ogólna teoria dotycząca ewolucji żywych systemów z materii nieożywionej..

Koncepcje Woese zostały włączone przez NASA do jej programu egzobiologii i do filozofii jej programów misji, które zostały wysłane na Marsa w celu poszukiwania oznak życia w 1975 roku..

Główne prace

Jego najważniejsze prace wymieniono poniżej:

- Ewolucja złożoności makromolekularnej (1971), gdzie przedstawiono ujednolicony model ewolucji złożoności makrocząsteczkowej.

- Bacterial Evolution (1987). Ta praca jest historycznym opisem tego, jak związek między mikrobiologią a ewolucją zaczyna zmieniać koncepcje dotyczące pochodzenia gatunków na Ziemi..

- Przodek wszechświata (1998). Opisuje uniwersalnego przodka jako zróżnicowaną społeczność komórek, która przetrwa i ewoluuje jako jednostka biologiczna.

- Interpretacja uniwersalnego drzewa filogenetycznego (2000). Ta praca odnosi się do tego, jak uniwersalne drzewo filogenetyczne nie tylko obejmuje całe istniejące życie, ale jego korzeń reprezentuje proces ewolucyjny przed pojawieniem się obecnych typów komórek.

- O ewolucji komórek (2002). W tej pracy Woese przedstawia teorię ewolucji organizacji komórkowej.

- Nowa biologia na nowe stulecie (2004). Jest to podejście do potrzeby zmiany podejścia do biologii w świetle nowych odkryć świata żywego..

- Zbiorowa ewolucja i kod genetyczny (2006). Przedstawia dynamiczną teorię ewolucji kodu genetycznego.

Bibliografia

  1. Woese C, Fox GE. (1977). Struktura filogenetyczna domeny prokariotycznej: królestwa pierwotne. Pobrane 11 listopada z: ncbi.nlm.nih.gov
  2. Woese C. (2004). Nowa biologia na nowy wiek. Przeglądy mikrobiologii i biologii molekularnej. Pobrane 12 listopada z: ncbi.nlm.nih.gov
  3. Rummel J. (2014). Carl Woese, Dick Young i korzenie astrobiologii. Pobrane 13 listopada z: ncbi.nlm.nih.gov
  4. Goldenfeld, N., Pace, N. (2013). Carl R. Woese (1928-2012). Pobrane 13 listopada z: science.sciencemag.org
  5. Projekt ludzkiego mikrobiomu, HMP. Pobrane 13 listopada z: hmpdacc.org.
  6. Dick S, Strick J. (2004). Żywy wszechświat: NASA i rozwój astrobiologii. Pobrane 12 listopada z: Google Scholar
  7. Klein H. (1974). Automijał eksperymenty związane z wykrywaniem życia podczas misji Wikingów na Marsa. Pobrane 12 listopada z: nlm.nih.gov

Jeszcze bez komentarzy